La pose de clips, petites billes, est effectuée à l'Institut Curie ou dans le centre partenaire. Les clips de repérages sont posés sur la sclèrotique, la membrane blanche et opaque qui forme le « blanc » de l'il, autour de la base tumorale. Ils sont amagnétiques donc n'interfèrent ni avec l'IRM ni avec le scanner. Les clips en tantale d'un diamètre d'environ 2mm, servent au repérage radiologique de l'orientation de l'il à chaque séance de traitement. Cette opération est effectuée sous anesthésie générale. Sauf cas particuliers, les clips ne sont pas retirés.
Diverses mesures d'espacement entre les clips sont effectuées au cours de l'intervention. Elles seront utilisées lors de la dosimétrie, calcul de la dose optimale et du parcours du rayonnement.